Отён основал римский император Август. Несмотря на многочисленные вторжения и грабежи, долгие столетия город был важным культурным и политическим центром. С тех времен здесь сохранились массивные городские ворота Cент-Андре и д'Арру, остатки римского театра, где проходит Летний исторический фестиваль в Отёне, руины древнего храма бога Януса, надгробная пирамида Пьер-де-Куар, могила жреца-друида Дивитиакуса.
Но после того как столицей Бургундского королевства стал Дижон, значимость Отёна сошла на нет. Второй расцвет город пережил уже в начале индустриальной эпохи, когда здесь нашли несколько важных полезных ископаемых.
Любопытно, что в этом городе гораздо более мягкий и теплый климат, чем во многих других местах Бургундии. Здесь проходит рекордное количество праздников и торжественных мероприятий.